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BD Rhapsody: 單細胞分析工作流程
1. BD Rhapsody 核心(xin)技術之微孔板
一(yi)個(ge)微孔 = 一(yi)個(ge)單細胞 + 一(yi)個(ge)磁(ci)珠
BD Rhapsody Express單細胞分析系統提供的單細胞分割,以微孔為基礎,功能強大。
● 限度一套臺式設備,沒有(you)射流(liu)泵
● 當細胞在重力(li)作(zuo)用下(xia)沉入(ru)微孔時,可(ke)以對(dui)其進行(xing)溫和的處理
● 每個BD Rhapsody微孔板(ban)均包括一個超過(guo)22萬個分區的(de)微孔陣(zhen)列
● BD Rhapsody"微孔(kong)板體(ti)積約為600μL,稀釋細胞懸(xuan)浮液可直接裝入微孔(kong)板,無(wu)需將其濃縮到非常小的體(ti)積
● 由于沒有微流通道(dao),因此不需(xu)要(yao)擔心通道(dao)堵(du)塞的問(wen)題
● 微孔經過特(te)殊處理(li),以防(fang)止細胞粘附在表(biao)面,并進(jin)行深入的質量控制(zhi)
Rhapsody利用微孔進行單細(xi)胞分離,屬于Microwell-seq。 20萬(wan)個(ge)微孔的(de)尺寸被設計成(cheng)一(yi)(yi)(yi)個(ge)微孔恰好可(ke)以容納一(yi)(yi)(yi)個(ge)bead+一(yi)(yi)(yi)個(ge)細(xi)胞。
2. BD Rhapsody核心技術之(zhi)Barcoded Bead
3. 單(dan)細胞文庫制(zhi)備(bei)及測序
Single cell isolation and capture流(liu)程圖
4. BD Rhapsody技術(shu)優勢
成本更低(di)—— 靶向基因檢(jian)測(ce),避免看家基因占用的(de)大(da)量測(ce)序(xu)(xu)數(shu)據,大(da)大(da)節省了測(ce)序(xu)(xu)和分析成本。
超高細(xi)胞捕獲效(xiao)率(lv)—— 有(you)效(xiao)細(xi)胞捕獲率(lv)60%,遠高于市場上目前所有(you)大通量單細(xi)胞轉錄組測序(xu)技術。
罕(han)見轉(zhuan)錄本,更高(gao)檢出率—— 靶向定(ding)(ding)制panel,選定(ding)(ding)特定(ding)(ding)基因(yin)組合(he),提高(gao)UMI計(ji)數效(xiao)率,罕(han)見轉(zhuan)錄本檢測閾值更低。
克服PCR,擴(kuo)增(zeng)偏差——引入單(dan)細胞測序金標(biao)準,BD分子(zi)標(biao)簽,降低非(fei)特異(yi)性表達。
實(shi)理更高的(de)分辨率——可以分辨更精細、微(wei)觀的(de)細胞群和細胞亞種(zhong)群。
反轉錄的磁珠,超常穩(wen)存(cun)儲——完整(zheng)cDNA可在(zai)磁珠微(wei)球結(jie)構保(bao)存(cun)長3月(4度),隨(sui)用隨(sui)取。
靈活(huo)分樣組合——提高(gao)(gao)樣品通量(liang)(最多可(ke)(ke)12個樣本(ben)(ben)同時(shi)建(jian)庫,可(ke)(ke)等分,可(ke)(ke)隨機組合);又可(ke)(ke)以(yi)同時(shi)進行單細(xi)胞(bao)蛋(dan)白和轉錄(lu)組聯合檢測,大大降低成本(ben)(ben)的(de)同時(shi),也(ye)為單細(xi)胞(bao)多組學研究提供(gong)了更高(gao)(gao)效的(de)平臺。
5. BD Rhapsody產品(pin)線overview
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